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2006年 北美 生物信息学 申请指南---3 UPenn, UCSF, UC Berkeley [复制链接]

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发表于 2005-6-28 06:04:24 |显示全部楼层
今天准备介绍的有University of Pennsylvania, UC San Francisco和UC Berkeley大学。


    UPenn的医学院今年继续保持第4的排名,同时在NIH获得的资助中,排名第2。推荐的项目是Graduate Group in Genomics and Computational Biology (GCB) in Biomedical Graduate Studies in School of Medicine, http://www.med.upenn.edu/gcb

(1)GCB Program是和其他几个Program例如神经,分子,药学等,建立在医学院的生物医学研究生教育项目里面。目前有来自全校医学院,兽医学院,统计系,计算机系,生物工程系等37位教授。在GCB的faculty一栏,http://www.med.upenn.edu/gcb/fac.shtml 里面,列出了31位教授的名字。GCB在2004年新增了一名统计系的教授,Dr.Shane Jensen, http://www.wharton.upenn.edu/faculty/jensen.html,其主要研究方向是基因序列分析。他也是前面提到的Harvard统计系,Dr. Jun Liu的学生。

在2005年,GCB新增了5名教授,分别是:
•  Thomas Cappola- Medicine, School of Medicine  
•  Frederic Bushman- Microbiology, School of Medicine
•  Paul Sniegowski- Biology, School of Art and Sciences
•  Carlo Maley- Systems Biology, Wistar Institute
•  Qihong Huang- Molecular and Cell Biology, Wistar Institute

(2)GCB Program从2001年开始招生,目前有20个左右的学生。在美国的申请者一般在每年的2月被邀请去面试,在面试后的1到2周内会得到录取结果,不在美国的申请者会通过视频和4个教授交谈。
      每年招生人数会保持在5个左右,一般发出的offer数会是15个,三倍于5,因为最终有的人会拿到更好的offer去其他的学校。不过我很推荐这个学校,因为每年在1月初的时候它们就决定了邀请去面试人的名单,不象有的学校,拖到4月的时候才出结果。

(3)如果有CS背景的同学,也同时可以考虑申请CIS系的PhD项目,在CIS系,有4个教授从事生物信息研究,具体信息可以登陆到 http://www.cis.upenn.edu/departmental/research.shtml 浏览。

(4)如果有统计或者数学背景的同学,可以考虑申请UPenn统计系的PhD,Dr.Jensen是统计系目前唯一做这方面研究的教授,或许以后还会招新的教授。还有一个选择是,可以考虑申请医学院的生物医学研究生教育项目里面的Biostatistics Program, 具体信息可以看 http://www.cceb.upenn.edu/main/education/biostatGraduate.html 。  
清华(or 北大)一个数学系的mm就申请到了2005年Fall。

接下来介绍的是,UCSF,这是多少学医学和生物人的梦想啊!值得介绍的专业是:
Graduate Program in Biological and Medical Informatics, http://www.bmi.ucsf.edu/  

(1)整个Program有45名教授,非常庞大,研究力量也非常强。Program的录取要求是至少本科学历,同时the core curriculum assumes that students have substantial computer literacy, and are knowledgeable of the basic life sciences, introductory calculus, matrix manipulation, and elementary statistics. In addition, students should have additional coursework or experience in some aspect of computer science, which could include database or algorithm design, elementary knowledge of a programming language, software engineering, or database or system administration.
(2)2004年在它们的网站上看见了给国际学生的note,大意是申请它们这个program是如何如何困难,竞争如何如何厉害,给国际学生的奖学金非常有限,请大家不要浪费60美元的申请费。不过现在找不到这条信息了,算一个好的信号。

     同样的,提到UCSF就必须谈谈UC Berkeley了,UC Berkeley没有医学院,但是它的生物很强,同时,因为地理的关系,也和UCSF保持着很好的合作。UC Berkeley的Bioengineering系,http://bioeng.berkeley.edu/, 和UCSF合作成立了Joint Graduate Group in Bioengineering, http://bioeng.berkeley.edu/graduate/index.html

(1)研究方向就包括 Computational Biology, Bioinformatics, and Genomics,http://bioeng.berkeley.edu/graduate/bioinformatics.html, 有15位来自UC Berkeley和UCSF的教授。
(2)申请要求:要求申请者对生命科学有着浓厚的兴趣,同时要能证明有着很强的数学和物理的背景。另外,Appropriate academic preparation includes a two-year college mathematics sequence, including calculus and differential equations, and a one-year sequence in physics and chemistry, plus extensive upper-division work in either engineering or biology. A course in linear algebra is highly desirable.

UC Berkeley还建立了一个Graduate Group in Computational and Genomic Biology, http://computationalbiology.berkeley.edu/graduategroup.html . 但是和前面介绍的其他学校不同的是,这不是一个stand-alone的group,申请者需要通过申请单独的系来进入这个group。
   http://computationalbiology.berkeley.edu/graduategroup.html 列出了教授们的大致的研究方向,可以先看看对谁感兴趣,再申请具体的系。

   从http://www.stat.berkeley.edu/faculty/index.html 可以查到在统计系里面,哪些教授在做生物信息的研究工作,值得提到的有Dr. Michael I. Jordan, http://www.cs.berkeley.edu/~jordan/
   和Dr. Sandrine Dudoit, http://www.stat.berkeley.edu/~sandrine/ .
   
   在CS系,有3个教授从事计算生物的研究,分别是Michael Jordan, Richard Karp 和Gene Myer, http://www.eecs.berkeley.edu/Research/Areas/CS/CB/
^_^^_^^_^
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发表于 2005-6-28 13:50:48 |显示全部楼层
Thanks!
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RE: 2006年 北美 生物信息学 申请指南---3 UPenn, UCSF, UC Berkeley [修改]
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