2006年 北美 生物信息学 申请指南---2 Harvard,MIT,JHU,WUSTL

mayagaoUID：56991

从这份帖子开始，就进入了指南的中心内容了。我决定按US News 上2006 Top Medical Schools 的排名介绍各个学校的生物信息学专业。
     在北美，生物信息学被称为Bioinformatics，类似地，不少大学还建有Computational Biology （计算生物学）, Computational Molecular Biology （计算分子生物学）, Systems Biology （系统生物）, Genomics （基因组学）, Biomedical Science （生物医学），Quantitative Biology（数量生物）等专业。个中的区别是有的，取决于不同的研究课题和方向，但是以上的专业大家都可以考虑申请。
     我比较推荐申请单独的博士项目，因为这些项目一般成立的历史不太久，资金比较充足，所以好申请到奖学金。当然，也可以考虑申请具体的系，如果在这个系有教授从事生物信息方面的研究。
     因为生物信息学是一个新兴地交叉学科，和医学，生物结合尤其紧密，所以我打算按照美国的U.S. News的2006 Top Medical Schools排名介绍各个学校的生物信息学专业。虽然排名固然重要，但是申请的时候一定要结合自己的实际情况和研究方向去寻找自己所满意的学校。
     同时，一些建有生物信息学专业的学校没有医学院，我也会把它们列举出来。最后，我也会列举一些加拿大和新加坡的学校，可能也有申请者会考虑。
     首先让我们来看看U.S. News的2006 Top Medical Schools排名。网站
http://www.usnews.com/usnews/edu ... f/mdrrank_brief.php
列出了前46名。

第1： Harvard  

Bioinformatics and Integrative Genomics (BIG) program （http://big.chip.org/）

（1）具体的申请方法请参照 http://big.chip.org/admissions.html
（2）它强调申请者至少要取得工程或者物理或者计算机的本科学位，同时接受过生物，有机化学，物理化学或者热力学，生物化学和微积分的训练。
（3）因为BIG program是在Harvard和MIT合办的Division of Health Sciences and Technology (HST)下面，所以申请者可以通过MIT去申请，也可以通过Harvard申请。

Systems Biology Ph.D.Program in School of Medicine (http://sysbio.med.harvard.edu/phd/index.html)

(1)Harvard去年正式在医学院成立了Systems Biology系，也开始招收了2005年秋季第一班博士生。系上先有10个正式的faculty，整个PhD项目里面有22个faculty。值得一提的是，毕业于中科大的Dr.Zhuang （http://zhuang.harvard.edu/），做得非常好。
(2)对Systems Biology感兴趣的同学不妨考虑一下。去年好像有北大的同学申请过，不知道最后结果如何。

Biophysics Program (http://arep.med.harvard.edu/biophysics/#description)

(1)这也是一个交叉方向，主要是招收有很强物理，化学和数学背景的申请者，同时也接收来自生物和电子工程的申请者。
(2)这个Program也提供Computational Biology的training，具体信息请参见 http://arep.med.harvard.edu/compubio.html

Ph.D. Program in Statistics (http://www.gsas.harvard.edu/programs/degree/stats.html)
Ph.D. Program in Biostatistics (http://www.gsas.harvard.edu/programs/degree/biostat.html)
（1）这两个Program也值得推荐给学统计和数学的同学。在统计系，Liu Jun教授做得很出色，他建立的实验室叫生物信息实验室 （http://www.people.fas.harvard.edu/~junliu/），具体的一些研究方向包括单核苷酸多态性的基因分析，聚类算法，Monte Carlo 算法，优化算法，基因序列研究等。
（2）在生物统计系，也建有专门的生物计算方向，http://biosun1.harvard.edu/research/divisions/compbio/index.html 。Liu Jun教授也在这个系，他以前在Stanford的学生 Dr. Xiaole Liu 也在这儿，主要研究方向是基因序列分析， http://www.hsph.harvard.edu/faculty/XiaoleLiu.html 。



     谈到Harvard就不能不谈谈它的邻居，MIT。值得强烈推荐的是：

Computational and Systems Biology (CSB) Ph.D. Program  
（http://csbi.mit.edu/csbieducation/csbphd）
（1）到2006年秋季，是CSB的第3届招生了，我所了解的是，他们比较倾向于有生物和计算双学历的学生。当然，缺一方面背景的话，你一定要在另外一方面非常强。
（2）他们的研究力量很强，教授来自好几个系。纯计算机背景的同学也可以去MIT的EECS系看看他们的CS in Life Sciences 介绍（http://www.eecs.mit.edu/grad/CS-LS.html）。





第2： Johns Hopkins University

Program in Computational Biology (http://www.jhu.edu/~ibr/bwf/index.html)  
(1)    申请JHU的计算生物专业需要通过JHU的Program in Molecular & Computational Biophysics 去申请，http://www.jhu.edu/pmb/ 。他们鼓励有生物，化学，工程，数学，物理的背景的申请者去申请，当然有统计和计算机背景也是欢迎的。
(2)    具体研究方向包括了：
Protein and RNA: Folding, Energetics, and Dynamics
Macromolecular Recognition and Interactions
Membranes and Membrane Proteins
Ribosomes and RNPs
DNA Replication, Recombination, and Repair
Enzyme Mechanisms and Metabolic Pathways
Structure Determination by X-ray Crystallography and NMR
Gene Regulation Mechanisms
New Spectroscopic and Single Molecular Methods
Computational Approaches and Modeling in Biological Systems
Molecular Evolution




第3： Washington University in St. Louis

华盛顿大学的医学和生物医学分部 Division of Biology & Biomedical Sciences 一共有12个不同的graduate groups。值得推荐的有：
Computational Biology Program  

（http//dbbs.wustl.edu/dbbs/website.nsf/WV/0965C5D46739DD6186256D4F00691262? OpenDocument&DN=1103&C=Graduate+Students&U=C6A57C07D1F1A4AD86256D8600522802）


Molecular Biophysics Program
（http//dbbs.wustl.edu/dbbs/website.nsf/WV/CC0DCAA5385D8CF386256D4F00693804? OpenDocument&DN=1107&C=Graduate+Students&U=BFCA6EDE45235CC586256D8600526202）

Quantitative Human and Statistical Genetics Program
（http://dbbs.wustl.edu/dbbs/websi ... 82386256F0F005AB10D）

（1）有统计和数学背景可以考虑申请Quantitative Human and Statistical Genetics Program；有计算机背景可以考虑申请Computational Biology Program；有物理，化学背景可以考虑申请Molecular Biophysics Program。
（2）Computational Biology Program的Director是很有名的Gary D. Stormo, http://ural.wustl.edu/ , 同时Dr. Sean Eddy也非常出名，是Biological Sequence Analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids一书的作者之一 ，http://selab.wustl.edu/ 。 有计算机背景的同学为了增加录取机会，也应该考虑同时申请Dept. of Computer Science and Engineering，http://www.cse.seas.wustl.edu/ 。在CSE，目前有三个教授从事Computational Genomics的研究，Michael R. Brent，Jeremy Buhler，和Weixiong Zhang,
http://www.cse.seas.wustl.edu/ComputationalScience.asp  。
（3）Quantitative Human and Statistical Genetics Program是2005年秋季第一次招生，具体研究方向请去它们的主页浏览。
（4）强烈推荐大家申请盛顿大学的医学和生物医学分部 Division of Biology & Biomedical Sciences下属的12个研究小组，理由是它们的研究的确非常强，还有就是在每年12月1号前能把申请资料寄到的话，申请费可以被waive掉，也能节省几十美刀啊，呵呵。不过，这里是非常难申请到的，祝大家好运!

阿姨来了@-@UID：115208

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Ding.