2006年 北美 生物信息学 申请指南---9 UC系统之UCI和USC

mayagaoUID：56991

指南7中介绍了在LA的UCLA，今天介绍一下同在LA的USC（USC是所私立学校，不属于UC系统），另外一个学校是UCI。

1．USC是所私立学校，位于LA的downtown，据说学校附近的治安不太好。
USC的专业是 Program in Computational Molecular Biology and Bioinformatics，链接是http://www-hto.usc.edu/ 。

（1）申请。这个program的老师来自4个系，包括Dept. of  Biological Sciences, Computer Science, Mathematics 和Biostatistics。提供的学位包括：
             PhD in Computational Biology and Bioinformatics
             http://www.usc.edu/dept/LAS/biosci/mcb/admission.html

             PhD in Applied Mathematics

             PhD in Computer Science

             PhD program in Statistical Genetics and Genetic Epidemiology
http://www.usc.edu/schools/medic ... ation/phd/sgge.html  

建议大家申请PhD in Computational Biology and Bioinformatics，不要申请费。FAQ有具体的解释 http://www.usc.edu/dept/LAS/biosci/mcb/faq.html 。

（2）    师资力量。目前一共有16位老师，http://www-hto.usc.edu/People/faculty.phtml?catID=1&DeptID=2  ，整个program还在继续招新的faculty。

最著名的应该算Michael Waterman了，被誉为生物信息学之父，http://www.cmb.usc.edu/people/msw/Waterman.html 。他1982年来到USC，从此推动了计算生物学的研究，目前是三个系的教授，2001年被选为美国科学院院士。

这个program还有四位中国教授，Xianghong Zhou, http://www.cmb.usc.edu/people/xjzhou/ , 她的lab是 Computational Lab of Integrative Genomics, http://zhoulab.usc.edu/ , 主要研究课题包括developing methods for the integrative analysis of heterogeneous genomic data and studying the evolution of biological networks; 她是在Swiss Federal Institute of Technology拿到的PhD，估计是在CBRG - Computational Biochemistry Research Group， http://www.cbrg.ethz.ch/  学习过。

另外一位年轻的中国教授是 Tim Ting Chen, 他同时是Biology, Computer Science and Mathematics三个系的assistant professor。他目前的研究课题包括the analysis of protein interactions, functions and pathways；the protein identification and sequencing via HPLC-tandem mass spectrometry, and the analysis of Human SNPs. 提到SNPs，感兴趣的同学可以去 http://www.hapmap.org/index.html.zh 看看， 这是当前一个很热地研究课题。

2。UCI的全称是UC Irvine， 整个学校的排名在不断地上升，去年又有人得到了Nobel奖，所在的社区气候环境好，是很多华人的理想之地。  
   
      UCI的School of Information and Computer Sciences的Ph.D. program提供了Concentration in Informatics in Biology and Medicine (IBAM)， http://www.ics.uci.edu/grad/degrees/index.php?track=ibam 。

（1）    研究方向包括gene finding, protein structure and function prediction, structural and functional genomics, proteomics, electronic patient record systems, medical decision support systems, guideline-based health care, medical information access, and human-computer interfaces for medical applications。目前共有6位教授，http://www.ics.uci.edu/faculty/area/area_biomed.php 。最著名的应该算Pierre Baldi， http://www.ics.uci.edu/~pfbaldi/ ，他的研究方向包括understanding and predicting protein structures, analyzing and modeling gene expression data and regulatory networks。
（2）课程学习。http://www.ics.uci.edu/grad/degrees/index.php?track=ibam 列出了这个方向需要学习的课程和选修的课程。
（3）申请。 UCI在2001年整合了School of Medicine，School of Biological Sciences，Donald Bren School of Information and Computer Science，School of Biological Sciences，Henry Samueli School of Engineering和School of Physical Sciences的力量建立了Institute for Genomics and Bioinformatics (IGB)，http://www.igb.uci.edu/about/about.html 。

            http://www.igb.uci.edu/people/faculty.html# 列出了IGB的director，7个core research方向的leaders包括Biomedical Engineering, Chemical Biology, Evolutionary Genomics, Functional Genomics, Human Genomics, Systems Biology, and Structural Genomics，和参与进来的faculty。

             IGB建有一个Biomedical Informatics Training (BIT) Program, 申请者需要先通过School of Medicine，School of Biological Sciences，Donald Bren School of Information and Computer Science，School of Biological Sciences，Henry Samueli School of Engineering和School of Physical Sciences申请四个track，才能进入BIT program。这四个track包括：

ME, Molecular Evolution track in the Department of Ecology and Evolutionary Biology;  

MBGB, Combined Molecular Biology, Genetics, and Biochemistry Program in the Schools of Biological Sciences and Medicine;  

CB, Chemical Biology track in the School of Physical Sciences;  

IBAM, Informatics in Biology and Medicine track in the School of Information and Computer Sciences.

http://www.igb.uci.edu/education/program_pre.html 介绍了申请要求和课程要求等等。