号召不打算改行的同学进行学术/非学术讨论

lingli_xiaoaiUID: 172506

换一个非学术的问题吧。。。

因为学校诡异的课程设置。没学过线性代数没学过概率。以后要是要读研，学生化或者偏药理，关系大不大？
还有比如BioInfo对于编程的要求有多高？看懂代码还是要能码出百行以上的程序？ ...
Puppy22 发表于 2009-1-29 23:11

生化肯定是不需要线性代数的，我学过，早就忘到九霄云外了，一般数学基础就可以了。。至于概率，一般来说统计用得比较多，如果没有统计基础，完全可以过来以后选课，不会有什么影响。

编程要求，我觉得写出程序来是需要的。。
某一门senior-graduate bioinfo的课程要求
Introduction to current topics in bioinformatics.  Applications may include sequence alignment, dynamic programming, hiddenMarkov models, phylogenetics trees, microarray data analysis, genomics, and proteomics. prerequisite: Instructor permission; STAT 151, CS 26
cs 26是computer program的课，通常是计算机大一下半学期必修。之前还有一门16。所以要求不算高，但是你得达到计算机专业大二学生的编程基础。他们上一门java，上一门算法。

so猫UID: 148633

换一个非学术的问题吧。。。

因为学校诡异的课程设置。没学过线性代数没学过概率。以后要是要读研，学生化或者偏药理，关系大不大？
还有比如BioInfo对于编程的要求有多高？看懂代码还是要能码出百行以上的程序？ ...
Puppy22 发表于 2009-1-29 23:11

我个人觉得无论是线代还是概率最好有空自己学一下，主要是学一个思维的方式，做体什么的没必要。大概了解这个学科都是用来干吗的就行了。
以前学校不开时以前学校的事情，想学自己买本书看就行。不是老师教的知识才是知识。
不用太担心bi，中国学生的数理能力一学就会了，代码那些都是死的。主要是思维方式。其实我觉得如果要了解基本的编程思路，好好看看c语言我觉得挺有帮助的。

so猫UID: 148633

药物作用的靶点太多，也可能同一种药物作用多个靶点。不能只看作用于某点，key regulator，就把他当作治疗某一种病的药。因为别的通道的激活或抑制也会发生作用。正副作用。如何平衡？
我太困惑了。
d.rain 发表于 2009-1-29 19:04

的确存在这个问题，所以药物才会有副作用，所以才需要三步的clinical trials。
我老师说了，如果说单纯的做某种蛋白或者酶的抑制剂，那实在太容易了，但是那是杀人的毒药而不是救人的解药。要在两者之间找一个平衡点才行，至于怎么找，只能做高通筛。

so猫UID: 148633

我觉得细胞内应该会存在某种物质对错误折叠的多肽进行清除或者解开后再折叠。如果能够通过高水平表达这种蛋白的话（比如使用某种激活剂或者基因疗法），也应该是一种可能的疗法吧？但是感觉现在对于机制的研究还 ...
Puppy22 发表于 2009-1-29 21:58

有的。有一部分人在做chaparone，就是这个原理。而且现在大部分研究alzheimer's的人都是走得类似的道路，阻止错误的蛋白折叠。
但是肯定不是单纯的高水平表达这么简单啦。

你很厉害哦，我觉得这种原发性的大方向是最难想到的。

webowner1985UID: 146380

问问：新人进实验室一般先是谁带？高年级PhD还是techinician? 是不是要看实验室的习惯？

webowner1985UID: 146380

有搞胚胎的童鞋么: villous explant culture 指的是什么？

lingli_xiaoaiUID: 172506

问问：新人进实验室一般先是谁带？高年级PhD还是techinician? 是不是要看实验室的习惯？
webowner1985 发表于 2009-1-30 22:13

这边的老板都是亲自带学生的，有时候甚至包括怎么做实验，不过具体到实验技能方面，一般来说是高年级phd或者post-doc。

其实说带不是很确切，一般来说你自己得主动跟着去熟悉实验技能，每个人都是独立的。只有小本需要人带，phd 学生 一般彼此project都是独立的。这样的话，你有什么东西不懂，应该主动找高年级的学生提问题之类的。

tech一般不带学生，除非你是遇到什么新的实验不会做。

achillesheelUID: 2113233

HTS，CADD不如传统经验有用吧。

Puppy22UID: 2239597

HTS基本就是瞎搞，没搞出来啥，CADD就能骗某某杂志主编而已，效果不咋地。还是传统经验有用些。
achillesheel 发表于 2009-1-31 00:01

HTS没那么差吧。。。最近看的文献里面有不少化合物都是通过HTS弄出来的。。。否则实筛1万多个化合物怎么传统弄啊。。。CADD的话虽然不那么靠谱，毕竟能有那么一点帮助吧。。。

so猫UID: 148633

39# Puppy22

握手~ 我也这么觉得~
人类历史上像相对论那样一出世就改变了几千年的思维方式的事情太少了~ 大部分时候还是渐进式的发展~
从这个角度来说hts还是有用的~ 只是不是elixir就是了

mscofield39353UID: 2451332

喜欢做生物研究的人都是懂得付出，愿意牺牲的人，是真正的科学家
可是本人仍然在国内搞临床，还是出国搞基础之间徘徊。。。。

lingli_xiaoaiUID: 172506

喜欢做生物研究的人都是懂得付出，愿意牺牲的人，是真正的科学家
可是本人仍然在国内搞临床，还是出国搞基础之间徘徊。。。。
mscofield39353 发表于 2009-2-4 01:47

take you time.. you will figure it out.

GuessyUID: 2184792

喜欢做生物研究的人都是懂得付出，愿意牺牲的人，是真正的科学家
可是本人仍然在国内搞临床，还是出国搞基础之间徘徊。。。。
mscofield39353 发表于 2009-2-4 01:47

在做科研准备往临床挤的飘过。。。

Puppy22UID: 2239597

问个很傻的问题。。。

比如Nature系列里面，article, letter, comment有啥具体内容和份量上的区别？哪种更牛一点？

so猫UID: 148633

44# Puppy22


根据你写的文章本身的性质分得。
article是全文，一般要使一个比较完整的story，工作量一般很大。。
letter有点像communication，一般都是点子很新很好但是工作量未必有多少，但是点子一定要好。
comments一般都是约稿吧，我感觉，都是大牛高屋建瓴说说现在是怎么回事。

不存在质量好坏，看工作的性质把