Ecology and Evolutionary Biology, PhD 请教各位大神选校建议

1006647331UID: 3592161

我把三个首选的三个学校的信息放在下面，希望各位大神能提出一些选校的建议


石溪大学：

基本情况
8年在伦敦大学学院(University London College) 从本科拿到博士，英国人，黑人，2008年博士毕业，博士论文主要工作在非洲撒哈拉地区人类的种群遗传学，到美国亚利桑那大学和UCLA两个比较出名的实验室做了几个博后，2014年在石溪拿到教职，和另外一个2009年斯坦福毕业的PhD，两个新老师共享实验室。博后期间，有不少飙分的文章。

谷歌学术链接：
https://scholar.google.com.hk/citations?user=4iBr-xsAAAAJ&hl=zh-CN
实验室链接
http://life.bio.sunysb.edu/ee/veeramahlab

老师课题情况
1. 作为参与者（应该不是主要Principal investigator）参与过各两百万美元的长臂猿和great ape 两个基因组的测序计划，2013年NATURE文章第六作者，2014 Nature 文章第四作者。2. 现在正在申请所有猿类一个基因组突变率的项目，预算也是两百万美元，他作为Principal investigator，并且说申请下来就有RA给我，刚刚提交NIH。

我附上一个老师传给我这个新的猿类基因组的课题的项目 Specific Aims 这一部分，充分的展示一下这个课题，数据量应该是很客观的。
http://pan.baidu.com/s/1nt5hLcH

优势？
1. 趋势较好？机会较多？ 文章的影响因子起点较高？猿类的基因组与人相似，千人基因组计划实施会增大基因组分析的机会
2. 老师给学生的时间：这个老师第一次带学生，一对一的时间很多，hands-on

挑战：
1. 程序编写，计算机数学相关知识需要花较多时间补充
2. 一年只有21k的TA，时间紧张，在纽约地区（双人间 800$/month）
3. 新老师可能会比较催学生，工作强度会比较大
4. 新老师没有带学生的经验




佛罗里达大学

Rob Guralnick   Associate Prof.

老师的基本情况
97年UC Berkeley 毕业 博士应该是做贝类的Phylogenetics相关，又留在UCB读了博后，2000年入职 Colorado University Boulder 的生态进化系(专业排名TOP20)，并在博物馆作为无脊椎动物的Curator。今年转职于佛罗里达大学，担任佛罗里达大学自然历史博物馆（馆藏标本量全美第二） Curator of Informatics

谷歌学术链接
https://scholar.google.com.hk/citations?user=_v3wLbQAAAAJ&hl=zh-CN&oi=sra
实验室链接

老师主要研究方向
1.ecological modeling
他给我看了几个2015年的课题的pre-proposals 都表明在ecological modeling 上面比较侧重，就是在一个区域采样后，将Data放在不同的模型里，预测出整个区域的物种分布等。因为他不是在做模型，数学计算机相关模型的设计问题涉及的不多，主要还是在应用层面。
2 .phylogenomics and biodiversity informatics
一个比较新颖的领域 biodiversity informatics。 因为尤其是在生态学，每一个人描述同一个问题用的语言都是不一致，所以这个领域就是利用一种标准化的表达模式去将生态学的数据还有NCBI上基因组的数据统一，建立庞大系统的数据库，像当年NCBI一样。


老师课题情况
老师承诺4年的RA，因为在UF必须做一年的TA, 他这个方向本身大环境下经费比较少，但是他能很成功的拿到项目，很成功的给学生RA做。这几年的课题都是作为主要的PI：

2014年课题申请情况：

Lead PI. Pending.  Collaborative Research: ABI DEVELOPMENT: Notes from Nature: Advancing a Next Generation Citizen Science Platform For Biocollection Transcription. (NSF ABI program, $594,428 to U. Florida, 3 years, start date 3/1/2015)

Co-PI.  Pending.  Collaborative Research . Collaborative Research: ABI Development: An Online Workbench for Collating, Visualizing and Analyzing Phylogenies, Biological Traits and Range Distributions.  (NSF ABI program, ~84K to U. Florida, 3 years, start date 1/1/2015).

Collaborative PI.  Collaborative Research: VertLife Terrestrial: A complete global assembly of phylogenetic, trait, spatial and environment characteristics for a model clade.  (NSF GoLife Program, $179,986 to U. Florida, ~2.5 million dollar budget, 4 years, start date 10/1/2014)

Collaborative PI.  Collaborative Research: ABI Development: Advancing Map of Life's Impact and Capacity for Sharing, Integrating, and Using Global Spatial Biodiversity Knowledge  (NSF Adavnces in Biological Informatics $577,000 to CU Boulder, ~1.5 million dollar budget total, 4 years, start date 3/1/2014)


优势
1. 美国老板，选题自由度高
2. 实验室资源好，实验室平台起点高，佛罗里达博物馆标本多, 自己相关的经历匹配
3. 老师的funding 稳定，并且老师在这个方面比较看重，所以相对较成功

挑战：
1. 文章质量竞争上优势相对较小？以后的发展机会会比较局限在生物多样性领域？生物多样性的funding大趋势不是特别理想？
2. 虽然老师邮件回复及时，但跟学生交流时间有限（一周一次？），大部分时间只能跟博后交流。
3. 老师承诺过分积极，4年RA, 24k/year，感觉有点虚



宾州州立
Andy Deans  Associate Prof.

老师的基本情况


因为我有虾的形态学基础，所以做昆虫相对过渡比较好，和这个老师原来做过的比较匹配。

谷歌学术链接
https://scholar.google.com.hk/citations?user=PKxYhbIAAAAJ&hl=zh-CN
实验室链接:
http://deanslab.org/
老师的CV
https://docs.google.com/document/d/1Xtv_XK2pOUjMOInd01RjlTTlb4lTWnpkXAOqHgh7xmg/edit

老师主要研究方向
一个比较新颖的领域 biodiversity informatics。 因为尤其是在形态学方面，每一个人描述同一个问题用的语言都是不一致，所以这个领域就是利用一种标准化的表达模式去将形态学，生态学的数据还有NCBI上基因组的数据统一，建立庞大系统的数据库，像当年NCBI一样。
但这个老师基本是以形态学的信息学为主。

老师课题情况
老师承诺RA



优势
1. 实验室资源好，实验室平台起点高，PSU也有一个昆虫博物馆，PSU的昆虫学全美TOP5，能用到以前的形态学基础，RA 26k/year
2. 老师的funding 稳定，领域很新颖，比较容易拿到项目？
3. 形态学可能以后需求量会增大？尤其是用新的方法去研究形态学？

挑战：
1. 文章质量竞争上优势相对较小？以后的发展机会会比较局限在生物多样性领域或是昆虫领域？研究对象的局限性太明显？
2. 有一个博后留在那个实验室任职，可能跟老师交流比较少
3. 不知道以后的这个领域发展到什么程度，因为这个新的方法不是很容易接受，所以推广上会有不少困难

ArabidopsiserUID: 3586656

PSU~~~~

1006647331UID: 3592161

Arabidopsiser 发表于 2015-4-5 09:52
PSU~~~~

PSU这个方向超级冷的，连老师自己都说他的这个方法不容易被接受，请问您选的原因是什么呢

JackitUID: 3394331

CONG~~

王sirUID: 3599773

这种问题需要自己拿大主要，问也白问。

mmchong7UID: 3603776

大牛，顶礼膜拜。。

seithkoUID: 3560633

cong～～
同意四楼 都能自己分析出这么多 肯定有意向了 自己拿主意怎么选都不会错

notebkUID: 3372287

cong！
思前顾后那么多 实际情况变化跟不上计划 别自己想太美或太糟糕了 我的看法是没必要如此谨小慎微
觉得楼主可能真的比较纠结 症结在于太贪。。什么好的都想占。。。不过这是人之常情 找个最感兴趣的吧 找个工资养得起自己的 环境气候喜欢的 别年轻气盛的五六年晃过去了 你懂我什么意思。。。本就不是什么出路好的专业 还以为踏上了美国以后生活工作都光明起来了 其实不然。。。

andyding13UID: 2766348

看了一下，Stony Brook的组不错，PI的简历里看见几个熟悉的名字。
但钱够不够，关系到你接下来五年生活快乐程度。只有$21k，而且是TA，建议你权衡一下利弊。

1006647331UID: 3592161

andyding13 发表于 2015-4-8 17:25
看了一下，Stony Brook的组不错，PI的简历里看见几个熟悉的名字。
但钱够不够，关系到你接下来五年生活快乐 ...

大神 有一个关键的问题想要请教

这个human gemonics and genetics的课题是不是已经没有那么热了？方法上面又比较Old school？会不会有些好钱费事，砸钱发文章的感觉，发出来的好文章也很少？这个工作是不是有点偏技术工？

再加上如果自己造化不高的话，没有足够的能力去发掘这些数据分析点，会不会成为AP的苦工？

最后的风险就是这个项目还没有申请到，对于我这样的小本来说，为这个项目冒的风险过大了？今年NIH funding rate 这么低。

北辰远UID: 2320774

选需要你编程最多的，这样培养了自己的编程能力，要跑路也好跑路，TA工资不算啥，在美国F1学生自己搞钱的路子太多了。

ArabidopsiserUID: 3586656

北辰远 发表于 2015-4-8 22:39
选需要你编程最多的，这样培养了自己的编程能力，要跑路也好跑路，TA工资不算啥，在美国F1学生自己搞钱的路 ...

被前辈后一句话吸引了～～能道其详吗～～

北辰远UID: 2320774

Arabidopsiser 发表于 2015-4-8 22:45
被前辈后一句话吸引了～～能道其详吗～～

下单赚钱，机会很多，可以翻墙去mitbbs二手版和电子商务版看看。

andyding13UID: 2766348

1006647331 发表于 2015-4-8 22:36
大神 有一个关键的问题想要请教

这个human gemonics and genetics的课题是不是已经没有那么热了？方法 ...

human genetics/genomics还是很热的（而且容易发好文章），而且相比其他课题应该比较好拿funding。NIH只fund model organism的study的。
砸钱确实能发好文章。如果不砸钱，能发好文章要靠好idea。funding还没拿到确实是一个问题。建议你还是权衡一下。

北辰远UID: 2320774

实在纠结就选编程多的，练好编程直接转cs，学好编程技能，自己掌控自己，那么多工作岗位等着你的，也不用等NSF，NIH施舍funding。